Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KarsQ99MN1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KarsQ99MN1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KarsQ99MN1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KarsQ99MN1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms