Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp1b4Q99ME6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp1b4Q99ME6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp1b4Q99ME6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms