Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PtprtQ99M80 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
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PtprtQ99M80 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
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PtprtQ99M80 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
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PtprtQ99M80 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PtprtQ99M80 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
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