Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmp1Q99KU0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmp1Q99KU0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms