Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prpf19Q99KP6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf19Q99KP6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms