Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps4Q99KG7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hps4Q99KG7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms