Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dok4Q99KE3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dok4Q99KE3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms