Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufsp2Q99K23 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufsp2Q99K23 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms