Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlgn1Q99K10 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlgn1Q99K10 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms