Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ddb2Q99J79 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddb2Q99J79 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms