Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Def8Q99J78 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Def8Q99J78 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms