Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apobec3Q99J72 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec3Q99J72 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms