Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ophn1Q99J31 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ophn1Q99J31 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms