Protein–RNA interactions for Protein: Q99J27

Slc33a1, Acetyl-coenzyme A transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc33a1Q99J27 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc33a1Q99J27 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms