Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ctu1Q99J10 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctu1Q99J10 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu1Q99J10 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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