Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf144aQ925F3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf144aQ925F3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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