Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prss28Q924N9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prss28Q924N9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms