Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4ip1Q924D0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms