Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Clip1Q922J3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Clip1Q922J3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clip1Q922J3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms