Protein–RNA interactions for Protein: Q921W0

Chmp1a, Charged multivesicular body protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1aQ921W0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp1aQ921W0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp1aQ921W0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp1aQ921W0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp1aQ921W0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp1aQ921W0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms