Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med28Q920D3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms