Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Pde6cQ91ZQ1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pde6cQ91ZQ1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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