Protein–RNA interactions for Protein: Q91XL2

Lnx2, Ligand of Numb protein X 2, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx2Q91XL2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lnx2Q91XL2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lnx2Q91XL2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms