Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usb1Q91W78 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usb1Q91W78 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usb1Q91W78 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usb1Q91W78 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usb1Q91W78 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usb1Q91W78 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usb1Q91W78 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usb1Q91W78 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usb1Q91W78 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usb1Q91W78 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usb1Q91W78 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usb1Q91W78 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usb1Q91W78 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usb1Q91W78 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usb1Q91W78 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usb1Q91W78 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usb1Q91W78 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms