Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klc3Q91W40 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klc3Q91W40 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klc3Q91W40 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klc3Q91W40 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klc3Q91W40 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klc3Q91W40 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klc3Q91W40 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klc3Q91W40 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms