Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cul7Q8VE73 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul7Q8VE73 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms