Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Fam20bQ8VCS3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Fam20bQ8VCS3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Fam20bQ8VCS3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Fam20bQ8VCS3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Fam20bQ8VCS3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Fam20bQ8VCS3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Fam20bQ8VCS3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam20bQ8VCS3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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