Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ubxn4Q8VCH8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ubxn4Q8VCH8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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