Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc12Q8R344 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms