Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2K8

Uncharacterized protein C1orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R2K8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8R2K8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8R2K8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8R2K8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8R2K8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms