Protein–RNA interactions for Protein: Q8R268

Vmn1r212, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r212Q8R268 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r212Q8R268 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r212Q8R268 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms