Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg10Q8R1P4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms