Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sumf1Q8R0F3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sumf1Q8R0F3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms