Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc12Q8K5B8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc12Q8K5B8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms