Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r72Q8K3N7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms