Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OptnQ8K3K8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OptnQ8K3K8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms