Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk5rap2Q8K389 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk5rap2Q8K389 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms