Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo18Q8K2I9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo18Q8K2I9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms