Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Neil3Q8K203 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil3Q8K203 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neil3Q8K203 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Neil3Q8K203 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Neil3Q8K203 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms