Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr1eQ8K202 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms