Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sde2Q8K1J5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sde2Q8K1J5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms