Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pnma3Q8JZW8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pnma3Q8JZW8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
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