Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ9

Eif3b, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3bQ8JZQ9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3bQ8JZQ9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eif3bQ8JZQ9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms