Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Znf628Q8CJ78 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf628Q8CJ78 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms