Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mterf1aQ8CHZ9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mterf1aQ8CHZ9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms