Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ep400Q8CHI8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms