Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab11fip3Q8CHD8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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