Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Upp2Q8CGR7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Upp2Q8CGR7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms