Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp27Q8CEG8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp27Q8CEG8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms