Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc63Q8CDV6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc63Q8CDV6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc63Q8CDV6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc63Q8CDV6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc63Q8CDV6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc63Q8CDV6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc63Q8CDV6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc63Q8CDV6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc63Q8CDV6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc63Q8CDV6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc63Q8CDV6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc63Q8CDV6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc63Q8CDV6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc63Q8CDV6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc63Q8CDV6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc63Q8CDV6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc63Q8CDV6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms